《經濟研究》1998年被國家新聞出版署評定為“全國百種重點社科期刊”, 2000年獲第二屆“全國百種重點社科期刊獎”和首屆“國家期刊獎”兩項大獎,2002年又獲第二屆“國家期刊獎”,是唯一入選的經濟理論刊物。
《經濟研究》在近年公布的由南京大學和香港科技大學合作研制的《中文社會科學引文索引》(CSSCI)統計結果中,影響因子、被引總次數和被引指數在社科期刊中連續名列第一。在2005和2007年公布的我國經濟學最高獎——孫冶方經濟科學獎的評選結果中,有5篇和6篇論文獲得論文獎,占該獎項論文獎總數的50%、60%。